מערכת התשלומים מאפשרת לשלם לספקים בשתי הדרכים הבאות:
- שקים שמודפסים באמצעות תוכנת חשבשבת.
- הוראות העברה ישירה לבנק באמצעות מס”ב (המסלקה הבנקאית)
כאשר מפיקים תשלומים, חשבשבת מפרטת את החשבוניות הפתוחות של כל ספק.
- ניתן לסמן חשבוניות שלא ישולמו.
- ניתן להקטין את הסכום לתשלום (תשלום ע”ח). חשבשבת תעקוב אחר יתרת החוב, ובעת התשלום הבא תציג את היתרה לתשלום.
- ניתן לשנות את מועד התשלום.
- ניתן לרכז כמה תשלומים לתשלום אחד.
- ניתן לפצל תשלום למספר תשלומים בתאריכים שונים.
- בעת הפקת התשלומים חשבשבת רושמת את פקודת היומן ומסמנת סגירות בין החשבוניות לבין התשלומים.
- חשבשבת בודקת את תוקף האישור על ניכוי במקור, ומנכה את הסכומים לפי האישור.
*עסקים שמפיקים שקים מכמה חשבונות בנק יכולים להשתמש במדפסת עם דיו מגנטית. בשיטה זו מדפיסים את השיקים על נייר לבן, וחשבשבת מדפיסה גם את הפס המגנטי.